沉积型碳酸锰矿石中，主要锰矿物是菱锰矿、钙菱锰矿、含锰方解石和菱锰铁矿等;脉石有硅酸盐和碳酸盐矿物;也常伴生硫和铁等杂质。矿石一般比较复杂，锰矿物嵌布粒度细到几微米，不易解离，往往难于得到较高的精矿品位。
但是，并不是所有碳酸锰矿石都是细粒浸染状，佛瑞机械曾为南非纳米比亚客户提供过全套碳酸锰矿石的重选工艺和重选设备。该客户的碳酸锰矿石有用矿物就成粗粒嵌布，伴生脉石多为石英，锰矿石和脉石的比重差非常明显，很适合使用重选法进行选矿提纯。
碳酸锰矿石选矿生产实践较少，研究了强磁选、重介质选矿和浮选等方法。有的沉积型含硫碳酸锰矿石，产业：上采用了炭质页岩、黄铁矿和锰矿物的顺序优先浮选流程。有的热液型含铅锌碳酸锰矿石，采用了浮选一强磁选流程。某些含硫富锰矿石，锰矿物主要是硫锰矿，可以采用焙烧方法除硫。有的富碳酸锰矿石生产上也采用焙烧方法，除往挥发成分，得到成品矿石。
氧化锰和碳酸锰矿石中都含有一些难选矿石，锰与铁、磷或脉石紧密共生，嵌布粒度极细，难以分选，可以考虑用冶炼方法处理。例如，处理高磷高铁锰矿石的富锰渣法，生产活性二氧化锰的硝酸浸出法和生产金属锰的电解法等均已有产业生产。此外，还在研究连二硫酸钙法和细菌浸出法等。
遵义选矿厂采用浮选的方法处理碳酸锰矿石，投产后由于一直未达到设计要求，后改为强磁选-浮选流程，工业指标良好，已用于工业生产。 遵义选矿厂碳酸锰选矿工艺:遵义选矿厂有破碎，磨矿，浮选，浓缩和过滤工序。破碎有粗碎，筛分，洗矿及闭路细碎作业组成。矿石破碎后经两段磨矿磨细至-200目占85%，再经过旋流器脱泥后进入浮选。在浮选作业中，先用2好友选碳，再用黄药浮选黄铁矿，最后用氧化石蜡皂在碳酸钠为调整剂和水玻璃为抑制剂的矿浆中选锰。实际生产中药剂用量为10公斤/吨/原矿左右。
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